Bayrağımız Ölüm, aristokrat Stede Bonnet (Rhys Darby) liderliğindeki bir grup amatör korsanı konu alıyor. Beyefendi korsan olarak bilinen Bonnet, İngiliz sömürgeciliği sırasında Barbados adasında zengin bir İngiliz ailesinde doğdu. Anne ve babasının servetini devraldıktan ve paralarının çoğunu kaybettikten sonra, suç dünyasına adım atmaya ve bir korsan ekibine katılıp Atlantik Okyanusunu keşfetmek ve karşılaştıkları herkesi soymak istediğine karar verir. Ancak yelkencilik deneyimi olmayan Bonnet, özellikle tüm zamanların en büyük korsanlarından biri olan Karasakal (Taika Waititi) ile karşı karşıya geldiğinde kaptanlık görevinin kolay olmayacağının farkına varır.
